La certification Qualiopi n’est délivrée que lorsque les non-conformités majeures éventuelles sont levées par l’auditeur. L’organisme dispose d’un délai de 3 mois pour les traiter. Dans le cadre d'un audit de surveillance, ce délai de 3 mois est renouvelable 1 fois.
Au bout de ce délai maximum de 3 mois (ou de 6 mois en audit de surveillance) si des non-conformités majeures persistent, le refus définitif est prononcé (audit initial) ou le retrait définitif est prononcé (audit de surveillance).
L’organisme peut alors représenter une demande après un délai de 3 mois. Il est à noter que le refus définitif est très rare. Dans la majorité des cas, il s’agit d’abandon volontaire de l’activité et par conséquent de la certification.